当駅開業前にも、現在の厄神駅が初代「国包駅」を名乗っていたが、当駅開業時に初代国包駅は厄神駅に改称された。

• 1916年（大正5年）11月22日 - 播州鉄道 厄神〜別所間の開通と同時に開業。旅客営業のみ。
• 1923年（大正12年）12月21日 - 播丹鉄道の駅となる。
• 1943年（昭和18年）6月1日 - 播丹鉄道の国有化により国鉄三木線の駅となる。
• 1973年（昭和48年）10月1日 - 駅無人化。
• 1976年（昭和51年） - 駅舎改築。
• 1985年（昭和60年）4月1日 - 三木鉄道の駅となる。
• 2008年（平成20年）4月1日 - 三木鉄道廃止に伴い、廃駅になる。代替バスの国包東バス停設置。
• 2009年（平成21年）6月 - 駅舎の解体作業が完了する。